Los programas funcionales están destinados a aquellos pacientes que no presentan alteraciones generalizadas, sino que mantienen un funcionamiento globalmente conservado pero con déficit en un área determinada y que afecta al desarrollo de su vida diaria, por lo que precisa tratamiento rehabilitador proporcione mejoras significativas en diferentes ámbitos de la salud, la autonomía y la calidad de vida de estas personas.
Los programas funcionales que el Instituto Charbel ofrece son: